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赤水河半鳆的遗传多样性和种群历史动态分析
李文静1; 王环珊1; 刘焕章1; 曹文宣1; 王小明2; 于江2; 朱昕2
2018
Source Publication水生生物学报
ISSN1000-3207
Volume42Issue:1Pages:106
Abstract在赤水河的水潦、茅台、二合、太平、赤水市5个样点共采集了168尾半鰐Hemiculterella sauvagei,通过线粒体DNA的细胞色素b (Cyt b)基因序列分析了半鰐种群遗传多样性和种群历史动态。获得序列长度为1137 bp,其中包含42个变异位点,13个单突变位点,29个简约信息位点。168条序列共检测到38种单倍型,单倍型多样性(H_d)和核苷酸多样性(P_i)分别为0.895±0.012和0.00487±0.00695。分子方差分析(Analysis of Molecular Variance,AMOVA)显示:遗传变异主要来源于种群内部(80.95%)。F_(st)值统计表明,赤水市种群与茅台、二合、水潦种群之间存在高度分化,与太平镇种群之间存在中度分化,其他种群之间无显著差异,这表明分布在赤水市和其他4个地理种群的半鰐应作为不同的管理单元(MU)进行保护。Mega 6.0软件计算5个种群之间的平均净遗传距离范围为0.004—0.006。中性检验结果为水潦、太平和赤水市的F_s值为负值,表明这3个地理种群的半鰐曾发生过种群扩张。采用1% per Myr的突变速率推算出半鰐水潦种群扩张时间大约在0.43百万年前,太平镇种群大约在0.40百万年前,赤水市种群大约在0.37百万年前。
Keyword赤水河 半鰐 遗传多样性 种群历史动态 遗传分化
DOI10.7541/2018.014
Language英语
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Document Type期刊论文
Identifierhttp://ir.ihb.ac.cn/handle/342005/36143
Collection水生生物多样性与资源保护研究中心_期刊论文
Affiliation1.中国科学院水生生物研究所
2.中国三峡建设管理有限公司
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GB/T 7714
李文静,王环珊,刘焕章,等. 赤水河半鳆的遗传多样性和种群历史动态分析[J]. 水生生物学报,2018,42(1):106.
APA 李文静.,王环珊.,刘焕章.,曹文宣.,王小明.,...&朱昕.(2018).赤水河半鳆的遗传多样性和种群历史动态分析.水生生物学报,42(1),106.
MLA 李文静,et al."赤水河半鳆的遗传多样性和种群历史动态分析".水生生物学报 42.1(2018):106.
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