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Bacterial Communities Associated with Four Cyanobacterial Genera Display Structural and Functional Differences: Evidence from an Experimental Approach
Zhu, Lin1,2; Zancarini, Anouk2; Louati, Imen2; De Cesare, Silvia2; Duval, Charlotte3; Tambosco, Kevin2; Bernard, Cecile3; Debroas, Didier4; Song, Lirong1; Leloup, Julie2; Humbert, Jean-Francois2
2016-10-24
Source PublicationFRONTIERS IN MICROBIOLOGY
ISSN1664-302X
Volume7Issue:1Pages:11
Abstract

To overcome the limitations associated with studying the interactions between bacterial communities (BCs) and cyanobacteria in natural environments, we compared the structural and functional diversities of the BCs associated with 15 non-axenic cyanobacterial strains in culture and two natural BCs sampled during cyanobacterial blooms. No significant differences in richness and diversity were found between the natural and cultivated BCs, although some of the cyanobacterial strains had been isolated 11 years earlier. Moreover, these BCs shared some similar characteristics, such as a very low abundance of Actinobacteria, but they display significant differences at the operational taxonomic unit (OTU) level. Overall, our findings suggest that BCs associated with cyanobacteria in culture are good models to better understand the interactions between heterotrophic bacteria and cyanobacteria. Additionally, BCs associated with heterocystous cyanobacterial strains cultivated in Z8X culture medium without nitrate (Aphanizomenon-Dolichospermum) demonstrated significant differences compared to BCs associated with non-heterocystous strains cultivated in Z8 culture medium (Planktothrix-Microcystis) in terms of their composition and their ability to utilize different carbon sources, suggesting the potential influence of cyanobacterial metabolism and/or culture media on associated BCs. Finally, half of the dominant OTUs in these BCs were specifically associated with cyanobacteria or other phytoplankton, whereas the remaining OTUs were generally associated with ecosystems containing high organic matter content, such as sludge or intestines.

Keywordbacterial communities cyanobacteria cultures natural samples functional and structural diversity pyrosequencing EcoPlates
DOI10.3389/fmicb.2016.01662
Funding OrganizationPHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche) ; PHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche) ; PHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche) ; PHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche) ; PHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche) ; PHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche) ; PHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche) ; PHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche) ; 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Indexed BySCI
Language英语
Funding ProjectPHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche)[ANR-11-JSV7-014-01]
WOS Research AreaMicrobiology
WOS SubjectMicrobiology
WOS IDWOS:000388632200001
WOS KeywordFRESH-WATER ECOSYSTEMS ; NITROGEN-FIXATION ; HETEROTROPHIC BACTERIA ; MICROBIAL DIVERSITY ; SEASONAL-CHANGES ; BACTERIOPLANKTON ; BLOOMS ; OCEAN ; ENVIRONMENTS ; DIAZOTROPHS
PublisherFRONTIERS MEDIA SA
Funding OrganizationPHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche) ; PHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche) ; PHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche) ; PHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche) ; PHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche) ; PHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche) ; PHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche) ; PHYCOCYANO project in the Jeunes Chercheurs-Jeunes Chercheuses program of the French ANR (Agence Nationale de la Recherche) ; 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Document Type期刊论文
Identifierhttp://ir.ihb.ac.cn/handle/342005/34065
Collection藻类生物学及应用研究中心_期刊论文
Corresponding AuthorHumbert, Jean-Francois
Affiliation1.Chinese Acad Sci, Inst Hydrobiol, State Key Lab Freshwater Ecol & Biotechnol, Wuhan, Peoples R China
2.UPMC INRA, IEES Paris UMR 7618, Paris, France
3.Sorbonne Univ, CNRS, UMR 7245, MCAM,Museum Natl Hist Nat, Paris, France
4.Univ Clermont Ferrand, Lab Microorganismes Genome & Environm, Clermont Ferrand, France
Recommended Citation
GB/T 7714
Zhu, Lin,Zancarini, Anouk,Louati, Imen,et al. Bacterial Communities Associated with Four Cyanobacterial Genera Display Structural and Functional Differences: Evidence from an Experimental Approach[J]. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY,2016,7(1):11.
APA Zhu, Lin.,Zancarini, Anouk.,Louati, Imen.,De Cesare, Silvia.,Duval, Charlotte.,...&Humbert, Jean-Francois.(2016).Bacterial Communities Associated with Four Cyanobacterial Genera Display Structural and Functional Differences: Evidence from an Experimental Approach.FRONTIERS IN MICROBIOLOGY,7(1),11.
MLA Zhu, Lin,et al."Bacterial Communities Associated with Four Cyanobacterial Genera Display Structural and Functional Differences: Evidence from an Experimental Approach".FRONTIERS IN MICROBIOLOGY 7.1(2016):11.
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