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题名: 斜带石斑鱼MyD88基因的克隆与表达
作者: 韦友传 ; 高谦 ; 昌鸣先 ; 罗廷荣
关键词: 斜带石斑鱼 ; 表达 ; 髓样分化因子88(MyD88)
刊名: 基因组学与应用生物学
发表日期: 2011
期: 3
收录类别: CSCD
部门归属: 广西大学亚热带生物资源保护利用重点实验室;中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室;广西大学生命科学与技术学院
资助者: 国家自然科学基金委员会; 广东省人民政府自然科学联基金(U0631010)共同资助
摘要: 本研究运用RACE-PCR技术获得斜带石斑鱼(Epinephelus coioides)髓样分化因子88(myeloid differentiation factor 88,MyD88)基因,并对该基因进行生物信息学和表达模式分析。研究结果表明1795bp的cDNA全长序列,包括ORF 870 bp、5'UTR 243 bp和3'UTR 682 bp,3'UTR存在1个多聚腺苷酸加尾信号(AATAAA)和两个mRNA不稳定基序(ATTTA)。SMART软件预测该蛋白N端和C端分别存在死亡结构域和TIR结构域(Toll/IL-1 receptor homology domain,TIR);与其它脊椎动物MyD88的序列同一性达57.1%~78.7%;用NJ法构建的系统进化树中,斜带石斑鱼MyD88和其它已报导的鱼类MyD88聚为一枝。qPCR检测结果显示MyD88基因mRNA主要表达于肝脏、脾脏、头肾和胸腺等组织。本研究为进一步探讨MyD88在斜带石斑鱼TLR信号传导中的作用奠定基础。
语种: 中文
ISSN号: 1674-568X
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内容类型: 期刊论文
URI标识: http://ir.ihb.ac.cn/handle/342005/16103
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斜带石斑鱼MyD88基因的克隆与表达.PDF(4290KB)----开放获取--View Download

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