| 草鱼Ⅰ型微卫星标记的发掘及其多态性检测 | |
| 李偲; 刘航; 黄容; 李华英; 石米娟; 廖兰杰; 朱作言; 汪亚平 | |
| 2011 | |
| Source Publication | 水生生物学报
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| ISSN | 1000-3207 |
| Issue | 4 |
| Abstract | 表达序列标签(EST)是发掘Ⅰ型微卫星标记的重要资源。研究运用生物信息学方法,从草鱼头肾组织3027条EST序列中搜索到322个微卫星位点,占整个EST数据库的10.6%。其中,二核苷酸重复位点151个(46.9%),三核苷酸重复位点137个(42.5%),四、五、六核苷酸重复位点较少;在二核苷酸重复位点中,AC/GT重复位点最为丰富,占二核苷酸重复位点总数的50.3%,AG/CT重复次之,占二核苷酸重复位点总数的40.4%,AT和GC重复较少。10个微卫星位点的多态性检测结果显示,4个位点在草鱼测试群体中呈多态性,多态性位点的平均多态信息含量(PIC)和平均遗传杂合度(H)分别为0.5236和0.5441,其中,2个多态性位点的PIC值大于0.5,呈现高度多态性特征。Ⅰ型微卫星标记将为草鱼遗传连锁图谱构建和QTL分析提供有效的基因分子标记。 |
| Keyword | 草鱼 微卫星标记 多态信息含量 |
| Department | 中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室;中国科学院研究生院 |
| Funding Organization | 国家自然科学基金(30771664); 973项目(2009CB118701); 中国科学院方向性项目(KSCX2-YW-N-021)资助 ; 国家自然科学基金(30771664); 973项目(2009CB118701); 中国科学院方向性项目(KSCX2-YW-N-021)资助 ; 国家自然科学基金(30771664); 973项目(2009CB118701); 中国科学院方向性项目(KSCX2-YW-N-021)资助 ; 国家自然科学基金(30771664); 973项目(2009CB118701); 中国科学院方向性项目(KSCX2-YW-N-021)资助 |
| Indexed By | CSCD |
| Language | 中文 |
| CSCD ID | CSCD:4384317 |
| Funding Organization | 国家自然科学基金(30771664); 973项目(2009CB118701); 中国科学院方向性项目(KSCX2-YW-N-021)资助 ; 国家自然科学基金(30771664); 973项目(2009CB118701); 中国科学院方向性项目(KSCX2-YW-N-021)资助 ; 国家自然科学基金(30771664); 973项目(2009CB118701); 中国科学院方向性项目(KSCX2-YW-N-021)资助 ; 国家自然科学基金(30771664); 973项目(2009CB118701); 中国科学院方向性项目(KSCX2-YW-N-021)资助 |
| Citation statistics |
Cited Times:9[CSCD]
[CSCD Record]
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| Document Type | 期刊论文 |
| Identifier | http://ir.ihb.ac.cn/handle/342005/16093 |
| Collection | 鱼类生物学及渔业生物技术研究中心_期刊论文 |
| Recommended Citation GB/T 7714 | 李偲,刘航,黄容,等. 草鱼Ⅰ型微卫星标记的发掘及其多态性检测[J]. 水生生物学报,2011(4). |
| APA | 李偲.,刘航.,黄容.,李华英.,石米娟.,...&汪亚平.(2011).草鱼Ⅰ型微卫星标记的发掘及其多态性检测.水生生物学报(4). |
| MLA | 李偲,et al."草鱼Ⅰ型微卫星标记的发掘及其多态性检测".水生生物学报 .4(2011). |
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