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草鱼Ⅰ型微卫星标记的发掘及其多态性检测
李偲; 刘航; 黄容; 李华英; 石米娟; 廖兰杰; 朱作言; 汪亚平
2011
Source Publication水生生物学报
ISSN1000-3207
Issue4
Abstract表达序列标签(EST)是发掘Ⅰ型微卫星标记的重要资源。研究运用生物信息学方法,从草鱼头肾组织3027条EST序列中搜索到322个微卫星位点,占整个EST数据库的10.6%。其中,二核苷酸重复位点151个(46.9%),三核苷酸重复位点137个(42.5%),四、五、六核苷酸重复位点较少;在二核苷酸重复位点中,AC/GT重复位点最为丰富,占二核苷酸重复位点总数的50.3%,AG/CT重复次之,占二核苷酸重复位点总数的40.4%,AT和GC重复较少。10个微卫星位点的多态性检测结果显示,4个位点在草鱼测试群体中呈多态性,多态性位点的平均多态信息含量(PIC)和平均遗传杂合度(H)分别为0.5236和0.5441,其中,2个多态性位点的PIC值大于0.5,呈现高度多态性特征。Ⅰ型微卫星标记将为草鱼遗传连锁图谱构建和QTL分析提供有效的基因分子标记。
Keyword草鱼 微卫星标记 多态信息含量
Department中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室;中国科学院研究生院
Funding Organization国家自然科学基金(30771664); 973项目(2009CB118701); 中国科学院方向性项目(KSCX2-YW-N-021)资助 ; 国家自然科学基金(30771664); 973项目(2009CB118701); 中国科学院方向性项目(KSCX2-YW-N-021)资助 ; 国家自然科学基金(30771664); 973项目(2009CB118701); 中国科学院方向性项目(KSCX2-YW-N-021)资助 ; 国家自然科学基金(30771664); 973项目(2009CB118701); 中国科学院方向性项目(KSCX2-YW-N-021)资助
Indexed ByCSCD
Language中文
CSCD IDCSCD:4384317
Funding Organization国家自然科学基金(30771664); 973项目(2009CB118701); 中国科学院方向性项目(KSCX2-YW-N-021)资助 ; 国家自然科学基金(30771664); 973项目(2009CB118701); 中国科学院方向性项目(KSCX2-YW-N-021)资助 ; 国家自然科学基金(30771664); 973项目(2009CB118701); 中国科学院方向性项目(KSCX2-YW-N-021)资助 ; 国家自然科学基金(30771664); 973项目(2009CB118701); 中国科学院方向性项目(KSCX2-YW-N-021)资助
Citation statistics
Cited Times:9[CSCD]   [CSCD Record]
Document Type期刊论文
Identifierhttp://ir.ihb.ac.cn/handle/342005/16093
Collection鱼类生物学及渔业生物技术研究中心_期刊论文
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GB/T 7714
李偲,刘航,黄容,等. 草鱼Ⅰ型微卫星标记的发掘及其多态性检测[J]. 水生生物学报,2011(4).
APA 李偲.,刘航.,黄容.,李华英.,石米娟.,...&汪亚平.(2011).草鱼Ⅰ型微卫星标记的发掘及其多态性检测.水生生物学报(4).
MLA 李偲,et al."草鱼Ⅰ型微卫星标记的发掘及其多态性检测".水生生物学报 .4(2011).
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