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题名: 三种室内饲养鱼类肠道微生物群落PCR-DGGE指纹分析
作者: 李学梅 ; 余育和 ; 解绶启 ; 颜庆云 ; 陈宇航 ; 董小林
关键词: 斑点叉尾 ; 银鲫 ; 异育银鲫 ; PCR-DGGE ; 肠道微生物群落
刊名: 水生生物学报
发表日期: 2011
期: 3
收录类别: CSCD
部门归属: 中国科学院水生生物研究所中国科学院水生生物多样性与保护重点实验室;中国科学院研究生院;中国科学院水生生物研究所淡水生态与生物技术国家重点实验室
资助者: 国家重点基础研究发展计划(2007CB109205); 国家自然科学基金(30970358)资助
摘要: 以室内饲养的斑点叉尾(Ictalurus punctatus)、银鲫和异育银鲫(中科三号)(Carassius auratus gibelio)幼鱼为对象,通过PCR-DGGE指纹技术对其肠道微生物群落进行了探索研究。在三种鱼的肠道中检测到不同的PCR-DGGE指纹谱带,其中斑点叉尾的平均谱带数(7.5)相对于银鲫和异育银鲫的谱带数(分别为15和14)要少。基于PCR-DGGE指纹谱带及各谱带相对丰度的UPGMA聚类和MDS排序结果显示银鲫和异育银鲫肠道微生物相似性高,而与斑点叉尾的差异比较大;rank-abundance散点图及回归分析也显示斑点叉尾与银鲫、异育银鲫肠道微生物群落存在显著差异(P<0.05),而银鲫和异育银鲫之间无显著差异(P=0.383)。在斑点叉尾肠道中检测到的菌群主要是变形杆菌,包括γ-变形杆菌和α-变形杆菌;而银鲫和异育银鲫肠道中菌群主要包括梭杆菌属中的类群,还包括变形杆菌门中的气单胞菌属,以及一些未知的类群。以上结果均表明在所研究的三种鱼的幼鱼阶段,其肠道微生物组成在不同种类鱼中存在差异,且该差异受基因型的影响可能更大。
语种: 中文
ISSN号: 1000-3207
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内容类型: 期刊论文
URI标识: http://ir.ihb.ac.cn/handle/342005/16029
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三种室内饲养鱼类肠道微生物群落PCR-DGGE指纹分析.PDF(401KB)----开放获取--View Download

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李学梅;余育和;解绶启;颜庆云;陈宇航;董小林.三种室内饲养鱼类肠道微生物群落PCR-DGGE指纹分析,水生生物学报,2011,(3):
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