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鲤est-Ssr标记的开发及跨种扩增研究
王丹; 廖小林; 俞小牧; 程磊; 王春艳; 游翠红; 童金苟
2007
Source Publication2006年度学术研讨会论文摘要汇编
Abstract本研究主要运用生物信息学方法,结合适当的分子生物学和遗传学实验验证, 进行筛选开发鲤Est数据库中的微卫星标记(est-ssr)以及在近缘种类中的扩增研究。在1万余条鲤est中序列中,共发现ssr 555个(5.5%),其中二碱基和三碱基重复次数最多,在所有含ssr序列的鲤est数据库中分别占37.18%和30.81%。根据筛选得到的est-ssr序列,初步设计合成了60对est-ssr引物,在鲤、鲫和链中的多态性分别是42%、18%和5%。25个est-ssr位点在洞庭湖鲤鱼群体中的观测杂合度为0.13-1.00, 期望杂合度0.12-0.91,平均等位基因数7个;其中,19个est-ssr位点符合哈迪- 温伯格平衡(hwe),6个位点偏离hwe平衡。这些研究结果表明,本研究所开发的est-ssr 标记适合群体遗传学和比较基因组作图的研究。
Language中文
Document Type会议论文
Identifierhttp://ir.ihb.ac.cn/handle/342005/14768
Collection会议论文
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GB/T 7714
王丹,廖小林,俞小牧,等. 鲤est-Ssr标记的开发及跨种扩增研究[C],2007.
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